Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP100Q494V2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms