Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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