Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms