Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL24A1Q17RW2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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