Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms