Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCK2Q16822 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms