Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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