Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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