Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC37Q16543 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC37Q16543 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC37Q16543 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC37Q16543 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC37Q16543 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC37Q16543 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC37Q16543 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC37Q16543 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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