Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms