Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms