Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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