Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
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PTPRKQ15262 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
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PTPRKQ15262 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
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PTPRKQ15262 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
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PTPRKQ15262 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
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PTPRKQ15262 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
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PTPRKQ15262 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
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PTPRKQ15262 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
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