Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms