Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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