Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME4Q14997 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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