Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms