Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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