Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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NCOA4Q13772 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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NCOA4Q13772 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
NCOA4Q13772 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCOA4Q13772 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCOA4Q13772 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCOA4Q13772 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCOA4Q13772 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCOA4Q13772 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCOA4Q13772 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCOA4Q13772 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCOA4Q13772 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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