Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms