Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCIRG1Q13488 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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