Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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