Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3B2Q13367 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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