Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms