Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SEMA3BQ13214 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms