Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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IFT88Q13099 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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IFT88Q13099 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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IFT88Q13099 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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IFT88Q13099 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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IFT88Q13099 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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IFT88Q13099 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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