Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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FOXD4Q12950 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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FOXD4Q12950 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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FOXD4Q12950 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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