Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 WDR73-209ENST00000559178 933 ntTSL 38.06□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 25
SF3A3Q12874 WDR73-216ENST00000560252 1180 ntTSL 27.45□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 25
SF3A3Q12874 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.145e-8■■■■□ 25
SF3A3Q12874 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.922e-7■■■■□ 25
SF3A3Q12874 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.722e-7■■■■□ 25
SF3A3Q12874 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.712e-7■■■■□ 25
SF3A3Q12874 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.642e-7■■■■□ 25
SF3A3Q12874 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-7■■■■□ 25
SF3A3Q12874 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.515e-8■■■■□ 25
SF3A3Q12874 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-7■■■■□ 25
SF3A3Q12874 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-7■■■■□ 25
SF3A3Q12874 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.385e-8■■■■□ 25
SF3A3Q12874 HAUS4-208ENST00000553859 602 ntTSL 39.07□□□□□ -0.962e-7■■■■□ 25
SF3A3Q12874 HAUS4-213ENST00000554446 1129 ntTSL 58.83□□□□□ -12e-7■■■■□ 25
SF3A3Q12874 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 312.44□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 25
SF3A3Q12874 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 25
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SF3A3Q12874 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 25
SF3A3Q12874 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 25
SF3A3Q12874 KDM3A-205ENST00000441719 8741 ntTSL 211.88□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 25
SF3A3Q12874 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 25
SF3A3Q12874 SRRM2-217ENST00000573692 459 ntTSL 316.49■□□□□ 0.231e-323■■■■□ 25
SF3A3Q12874 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 25
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SF3A3Q12874 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 POLG-213ENST00000631044 4668 ntTSL 515.19■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 POLG-217ENST00000636774 4151 ntTSL 514.76□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.36e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.466e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.756e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.836e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.936e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 MOV10-204ENST00000413052 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.214e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 MOV10-203ENST00000369645 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.294e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.624e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.784e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 MOV10-217ENST00000496577 4312 ntTSL 29.97□□□□□ -0.814e-7■■■■□ 24.9
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SF3A3Q12874 NDRG2-213ENST00000449431 545 ntTSL 47.46□□□□□ -1.222e-10■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 NDRG2-228ENST00000554277 410 ntTSL 56.57□□□□□ -1.362e-10■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 NDRG2-278ENST00000635386 672 ntTSL 35.83□□□□□ -1.482e-10■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 NDRG2-205ENST00000366204 572 ntTSL 45.81□□□□□ -1.482e-10■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 PPIL2-205ENST00000446951 1926 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.046e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 215.36■□□□□ 0.058e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.575e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ARHGEF1-218ENST00000599589 2636 ntTSL 1 (best)21.12■□□□□ 0.977e-23■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ARHGEF1-213ENST00000595897 2973 ntTSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.627e-23■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ARHGEF1-207ENST00000594258 919 ntTSL 317.21■□□□□ 0.357e-23■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ARHGEF1-206ENST00000594044 834 ntTSL 511.61□□□□□ -0.557e-23■■■■□ 24.9
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SF3A3Q12874 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.634e-7■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 210.57□□□□□ -0.724e-7■■■■□ 24.9
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SF3A3Q12874 ODF2-203ENST00000372807 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-8■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ODF2-210ENST00000444119 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-8■■■■□ 24.9
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SF3A3Q12874 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.272e-8■■■■□ 24.9
SF3A3Q12874 ATP2A1-208ENST00000564732 831 ntTSL 511.98□□□□□ -0.491e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.862e-11■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-11■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.72e-11■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.152e-11■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 AP1G2-225ENST00000556743 1456 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 AP1G2-206ENST00000553629 1301 ntTSL 1 (best)12.03□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 AP1G2-227ENST00000556943 747 ntTSL 39.32□□□□□ -0.921e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 MOV10-207ENST00000471160 493 ntTSL 310.93□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 TMEM214-204ENST00000425720 740 ntTSL 57.89□□□□□ -1.153e-6■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.812e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 11e-6■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 TRMU-204ENST00000441818 1793 ntTSL 1 (best)21.08■□□□□ 0.969e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 TRMU-207ENST00000457572 1882 ntTSL 220.96■□□□□ 0.959e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.839e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 TRMU-205ENST00000453630 1775 ntTSL 220■□□□□ 0.799e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 TRMU-206ENST00000456595 1688 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.779e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 TRMU-203ENST00000381021 1830 ntTSL 219.72■□□□□ 0.759e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.559e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.411e-11■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 GAMT-203ENST00000591788 401 ntTSL 56.55□□□□□ -1.361e-11■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 POLE-212ENST00000539215 483 ntTSL 511.67□□□□□ -0.546e-18■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.568e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.436e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.536e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.56e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 SLC16A3-210ENST00000580189 872 ntTSL 518.02■□□□□ 0.488e-14■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 SLC16A3-215ENST00000582946 586 ntTSL 415.86■□□□□ 0.138e-14■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 SLC16A3-204ENST00000578522 535 ntTSL 413.96□□□□□ -0.178e-14■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 CROCCP2-201ENST00000362058 2029 ntTSL 225.49■■□□□ 1.673e-7■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-8■■■■□ 24.8
SF3A3Q12874 OSBPL3-208ENST00000409863 3490 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.383e-8■■■■□ 24.8
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