Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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TWF1Q12792 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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