Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ARHGEF5Q12774 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF5Q12774 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms