Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms