Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms