Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms