Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms