Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG1Q02413 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSG1Q02413 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms