Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms