Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms