Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYBPC1Q00872 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms