Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms