Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL20P78556 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL20P78556 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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