Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX3P78415 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX3P78415 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX3P78415 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX3P78415 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX3P78415 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX3P78415 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX3P78415 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX3P78415 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX3P78415 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms