Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms