Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms