Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms