Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms