Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms