Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ELLP55199 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELLP55199 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELLP55199 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms