Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOSBP53539 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOSBP53539 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOSBP53539 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms