Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP98P52948 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP98P52948 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP98P52948 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP98P52948 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP98P52948 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP98P52948 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP98P52948 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms