Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms